Actualmente existen en Alcalá un total de dieciséis parroquias, quince diocesanas y una castrense. De ellas dos son de origen medieval, San Pedro -aneja a la Catedral Magistral- y Santa María, la cual se trasladó a la antigua iglesia de la Compañía de Jesús tras haber quedado destruido su templo -la actual Capilla del Oidor- en la Guerra Civil.

La tercer parroquia histórica, la de Santiago, tuvo una existencia mucho más ajetreada que las anteriores. Fundada por el cardenal Cisneros en los albores del siglo XVI, se asentó en el edificio de la antigua mezquita, situado en la confluencia de las calles Santiago y Diego de Torres, aunque en el siglo XVII éste fue sustituido por un templo barroco que fue demolido por completo en 1965. En 1808 perdió el rango parroquial, llevando desde entonces una vida lánguida hasta que fue suprimida definitivamente en 1935. Cuando a principios de los años sesenta del siglo XX se crearon varias nuevas parroquias, una de ellas se acogió a la advocación de Santiago; ubicada inicialmente, de modo provisional, en la capilla de las Adoratrices, en el Paseo de la Estación, en los años setenta se trasladaría a su nuevo templo de la calle Torrelaguna.

La parroquia de San Isidro, aunque fundada también en los años sesenta del siglo XX, se asentó en el edificio barroco de la que fuera la antigua ermita de este santo, por lo cual, aunque moderna, entronca con la tradición histórica complutense.

Las restantes parroquias son de creación moderna y están asentadas en templos asimismo modernos, aunque algunas de ellas -San Diego, Virgen del Val, Santo Tomás de Villanueva y la recién creada de Santa Teresa de Jesús- ocupan en la actualidad instalaciones provisionales, en ocasiones desde hace bastantes años, a la espera de poder disponer de una sede definitiva.

Por lo que yo sé el obispado complutense tiene previsto crear nuevas parroquias, e incluso dispone de solares para ello, pero por el momento estos proyectos no han cristalizado todavía.

Nombre	Dirección	Teléfono	Correo	Web
Nuestra Señora de Loreto (Castrense)	Barberán y Collar, s/n	918816571
Nuestra Señora del Val	Av. Lope de Figueroa, 12; local 6	918777958
San Bartolomé	Paseo de los Curas, 22	918891656
San Diego	Luis de Torres, 3	918892430
San Francisco de Asís	Av. Reyes Católicos, 26	918890669
San Isidro Labrador	Pl. Santa María de la Cabeza, s/n	918811120
San José	Río Tajuña, 2	918813543
San Juan de Ávila	Av. Reyes Magos, s/n	918842847
San Marcos	Gran Canal, 7	918828371
San Pedro Apóstol	Empecinado, 2 (Catedral)	918880930
Santa María la Mayor	Libreros, 25	918880164
Santa Teresa de Jesús	Arturo Soria, 8	912657925
Santiago Apóstol	Torrelaguna, 2	918893568
Santo Ángel	Luis Miguel Dominguín, 2	918891137
Santo Tomás de Villanueva	Pío Baroja, 22	918020577
Virgen de Belén	Bartolomé de Castro, 2	918886347