El asentamiento de población en los nuevos barrios -Espartales, el Ensanche y la Garena-, en parte procedente de Madrid o de otros lugares de su área metropolitana, pero sobre todo la llegada masiva de inmigrantes, hicieron que la población de Alcalá creciera en los primeros años del siglo XXI muy por encima de las previsiones. Mientras en 2001 los habitantes censados eran alrededor de 172.000, tan sólo cinco años más tarde, en 2006, se rebasaban los 200.000, alcanzándose en 2013 un máximo cercano a los 205.000 a partir del cual, y a consecuencia de la crisis económica, comenzó a descender de forma lenta, pero continua, hasta los casi 194.000 habitantes de 2018, experimentando una ligera recuperación a partir de 2019. Éstos son los datos oficiales del Instituto Nacional de Estadística para el período comprendido entre 2001 y 2021, siempre referidos al 1 de enero de cada año:

2001	172.418		2009	204.574		2016	195.907
2002	179.602		2010	204.120		2017	194.310
2003	188.519		2011	203.686		2018	193.751
2004	191.545		2012	203.924		2019	195.649
2005	197.804		2013	204.823		2020	197.562
2006	201.380		2014	200.768		2021	195.982
2007	198.723		2015	198.750		2022	196.888
2008	203.645

Una parte importante de este incremento correspondió a la llegada de un elevado número de ciudadanos extranjeros, cuya presencia había sido casi testimonial hasta el año 2000 -3.954 personas, el 2,38% del censo- pero cuyo número se había doblado tan sólo un año más tarde: 8.315, el 4,82%, el 1 de enero de 2001. A partir de este momento, y mientras la población española se mantenía estable a lo largo de los siguientes dieciséis años en torno a los 160-165.000 habitantes, la población extranjera creció espectacularmente alcanzando en 2012 un máximo de 45.241 habitantes censados -el 22,19% de la población total- para, a partir de entonces, comenzar a decrecer de una manera continua hasta 2018, experimentando a partir de 2019 una leve recuperación paralela a la de la población total de Alcalá.

Según los últimos datos publicados por el INE, en 2018 la población foránea se había reducido hasta un valor ligeramente inferior a los 30.000 habitantes, el 15,39% del censo, lo que supone un descenso de 15.400 empadronados con respecto a 2012, equivalente al 34% del total, aunque cabe suponer que parte de esta cantidad pudiera deberse a las nacionalizaciones. Esta caída se suavizó gracias al repunte de 2019 y 2020 aunque en 2021, quizá por efecto de la pandemia de covid-19, perdió prácticamente todo lo ganado en el año anterior, quedando fijado el censo de ciudadanos extranjeros en 31.585, lo que equivale a un porcentaje ligeramente superior al 16%. 2022 supuso un ligero repunte en ambos colectivos, manteniéndose la proporción de población española prácticamente igual que en el año anterior. Los datos completos, año por año, están recogidos en la siguiente tabla:

Año	Total	Españoles	Extranjeros	% extr.		Año	Total	Españoles	Extranjeros	% extr.
1996	163.386	161.173	2.213	1,35		2010	204.120	161.450	42.670	20,90
1998	163.831	161.288	2.543	1,55		2011	203.686	160.879	42.807	21,02
1999	164.463	161.459	3.004	1,83		2012	203.924	158.683	45.241	22,19
2000	166.397	162.443	3.954	2,38		2013	204.823	161.961	42.862	20,93
2001	172.418	164.103	8.315	4,82		2014	200.768	162.734	38.034	18,94
2002	179.602	165.455	14.147	7,88		2015	198.750	163.396	35.354	17,79
2003	188.519	167.333	21.186	11,24		2016	195.907	163.750	32.157	16,41
2004	191.545	166.722	24.823	12,96		2017	194.310	163.969	30.341	15,61
2005	197.804	167.183	30.621	15,48		2018	193.751	163.933	29.818	15,39
2006	201.380	166.231	35.149	17,45		2019	195.649	164.502	31.147	15,92
2007	198.723	163.908	34.815	17,52		2020	197.562	165.420	32.142	16,27
2008	203.645	162.989	40.656	19,96		2021	195.982	164.397	31.585	16,12
2009	204.574	162.311	42.263	20,66		2022	196.888	165.183	31.705	16,10

Aunque en el padrón municipal de estos años figuran más de cien nacionalidades distintas, la procedencia mayoritaria de esta población inmigrante era de los países del este europeo, en especial de Rumania, cuyos nacionales llegaron a suponer más de la mitad de la población extranjera total, aunque también se asentaron en la ciudad significativas colonias de polacos, búlgaros o ucranianos. Otros colectivos importantes procedentes de otros continentes fueron, de América, los colombianos y ecuatorianos; de África los marroquíes y nigerianos, y de Asia los chinos, cuyo espectacular incremento fue el único que no se vio afectado por la crisis económica surgida a finales de la primera década del siglo, mientras otros experimentaron importantes descensos conforme avanzaba la crisis. Un caso particular fue el de los venezolanos, cuyo número se incrementó notablemente a partir de 2018 a causa de la grave crisis política, económica y social que padece este país.

Junto con la pérdida de población provocada por el retorno a sus países de un significativo número de residentes extranjeros, hay que considerar también la existencia de trasvases de población de Alcalá hacia los municipios cercanos en los que la vivienda era más barata, un fenómeno iniciado con anterioridad a 2001 pero que se incrementó notablemente a partir de este año. Aunque resulta evidente que no todo este crecimiento fue a costa de Alcalá, se dieron variaciones tan espectaculares en lo que llevamos de siglo como las de Camarma de Esteruelas, que pasó de los 2.500 a los 7.600 habitantes; Meco, de 7.000 a 15.100; Daganzo de Arriba, de 4.200 a 10.650; Valdeavero, de 640 a 1.700; Fresno de Torote, de 700 a 2.400; Los Santos de la Humosa, de 930 a 2.750; Santorcaz, de 270 a 940; Torres de la Alameda, de 4.500 a 7.700; Villalbilla, de 4.600 a 15.900, o Loeches, de 3.200 a 8.900.

Ya en la provincia de Guadalajara, pero dentro del área de influencia complutense, cabe reseñar incrementos asimismo importantes en municipios como Quer, que pasó de 87 a 945 habitantes; Torrejón del Rey, de 1.400 a 6.000; Valdeaveruelo, de 370 a 1.177; Villanueva de la Torre, de 2.100 a 6.600; El Pozo de Guadalajara, de 400 a 1.550, o Pioz, de 600 a 5.000. Caso especial por su importancia demográfica es el de Azuqueca de Henares, que pasó de los 20.400 habitantes de 2001 a los 35.200 de 2022.

Consecuencia directa de esta evolución demográfica, fue la aplicación a Alcalá, en noviembre de 2004, del estatuto de Gran Ciudad, lo que supone en la práctica un reforzamiento de las competencias del alcalde sobre el pleno municipal y una descentralización administrativa mediante la creación de cinco juntas de distrito en sustitución de las nueve delegaciones de distrito anteriores, las cuales comenzaron a ser operativas el 23 de marzo de 2007, aunque no quedarían constituidas oficialmente hasta el 12 de noviembre de 2009. En cuanto a los denominados “ayuntamientos de barrio” es decir, las juntas de distrito, éstas se constituyeron entre finales de octubre y principios de noviembre de 2011.

La dura crisis económica que azotó el país desde finales de la primera década del nuevo siglo marcó su profunda huella en Alcalá ya que, al igual que ocurriera tres décadas atrás, los cierres de numerosas empresas provocaron un espectacular incremento en el número de parados, que rebasaron los 20.000 en 2012. Especialmente llamativos, por su importancia y su arraigo histórico en la ciudad, fueron los de Electrolux (antigua Ibelsa) en septiembre de 2012 y el de la sección de saneamientos de Roca en abril de 2013, a la que siguió el cierre de la otra fábrica, la de bañeras, anunciado en mayo de 2022, quedando como único vestigio de la otrora importante factoría la actividad logística, es decir, su uso como almacén y centro de distribución.

La otra cara de la moneda la constituyeron el acuerdo de marzo de 2013 para mantener todos los puestos de trabajo de Química Sintética (una de las pocas empresas grandes que quedan en Alcalá) al menos durante diez años y la inauguración, en abril de ese mismo año, de un centro de procesamiento de datos de Telefónica en el campus universitario. Asimismo, en septiembre de 2016 la cadena de supermercados Lidl inauguró su nueva plataforma logística, asentada en el solar de la antigua fábrica de Ibelsa, y en octubre de 2020 Amazon hizo lo propio en el polígono industrial El Encín, al otro extremo de la ciudad, inaugurándose un mes después el centro logístico EAST Madrid Park justo al lado. A ellas se suma la plataforma logística de Inditex situada en Meco, junto al límite con el término municipal de Alcalá y al complejo penitenciario formado por las prisiones civiles y la militar. Como puede comprobarse, en estos últimos años hubo un importante cambio de la actividad industrial a la de almacenaje y distribución.

También fue noticia importante la celebración en Alcalá de las dos primeras convocatorias del Foro Económico Internacional Expansión, que tuvieron lugar tuvieron lugar en octubre de 2020 y en junio de 2021 respectivamente. Asimismo, la Mobile Week, un evento organizado por la sección española del Mobile World Congress centrado en la tecnología digital, celebró una de sus convenciones en Alcalá en 2021 con una segunda convocatoria en 2022.

Dentro de tan negro panorama un rayo de luz vino a ser la caída en la ciudad de gran parte (ciento treinta de las ciento sesenta series) del premio gordo del sorteo de navidad de 2012 vendido en una administración del barrio del Chorrillo, lo que supuso una lluvia de quinientos veinte millones de euros a los que se sumó otro medio millón largo correspondiente a varias series del tercer premio vendidas en los barrios del Val y Reyes Católicos, así como un Cuponazo de la ONCE, vendido la víspera también en Reyes Católicos, por valor de más de once millones de euros. Cuatro años más tarde la ciudad volvería a ser agraciada por la suerte con dos buenos pellizcos del segundo y de uno de los cuartos premios del sorteo de navidad de 2016, vendidos respectivamente en la calle Mayor y en Reyes Católicos y, tan sólo unos días más tarde, en enero de 2017, con un premio de casi 12,7 millones de euros en un sorteo de la Lotería Primitiva sellado en el Chorrillo.

Nunca antes habían tocado en Alcalá premios de semejante magnitud, existiendo tan sólo el precedente del segundo premio del sorteo de navidad de 1988, que tuvo un importe diez veces inferior al de éstos. No obstante, hubo años como 2019 en los que menudearon premios de notable importancia: la administración del barrio de San Isidro inauguró el año repartiendo más de tres millones de euros en el sorteo del Niño y lo cerró con casi un millón de euros más en el de navidad, mientras la Lotería Primitiva otorgaba 700.000 euros en septiembre en Juan de Austria y 724.000 en noviembre en el centro comercial de Alcalá Magna, ambos correspondientes a boletos únicos.

2020, un año nefasto para casi todo, trató bien a Alcalá en lo que la lotería se refiere, con una parte importante del segundo premio del sorteo de navidad, vendido en la administración del Corte Inglés, que dejó 56 millones en la ciudad. La suerte se repetiría en el sorteo del Niño de 2021 con otro segundo premio, vendido en esta ocasión por la administración de la galería Juan de Austria, y un tercero en la del centro comercial La Dehesa. Aunque a lo largo de 2021 fueron varios los premios de lotería y otros sorteos caídos en Alcalá, ninguno de ellos estuvo muy repartido tratándose en la mayoría de los casos de boletos o décimos sueltos. No obstante, cabe reseñar los pellizcos del segundo premio del sorteo de la lotería nacional del 16 de enero y otro segundo premio del sorteo del Niño de 2022, así como el euromillón conseguido por un vecino de Nueva Alcalá en febrero de 2021 y el millón de euros del sorteo de El Millón de Euromillones conseguido por un boleto sellado en noviembre de 2022 en un receptor de lotería -establecimientos que no son administraciones pero sí la venden- del barrio del Ensanche.